في 28 سبتمبر من عام 2009، تزوج الشيخ ناصر بن حمد من الشيخة شيخه، ابنة نائب رئيس الإمارات العربية المتحدة، رئيس مجلس الوزراء وزير الدفاع، حاكم إمارة دبي، الشيخ محمد بن راشد آل مكتوم. من هذا الزواج، رزقا بابنتهما الشيخة شيمة بنت ناصر آل خليفة في 16 يوليو 2010.
متزوج من الشيخة شيخة بنت محمد بن راشد آل مكتوم، وهي ابنة الأمير محمد بن راشد آل مكتوم، حاكم إمارة دبي. لديهما ابنة وأربعة أبناء.
- الشيخة شيمة بنت ناصر بن حمد آل خليفة (مواليد 2010)
- الشيخ حمد بن ناصر بن حمد آل خليفة (مواليد 2011)
- الشيخ محمد بن ناصر بن حمد آل خليفة (مواليد 2013)
- الشيخ حمدان بن ناصر بن حمد آل خليفة (مواليد 2015)
- الشيخ خالد بن ناصر بن حمد آل خليفة (مواليد 2017)
الشيخ ناصر بن حمد آل خليفة هو الابن الرابع للملك حمد بن عيسى آل خليفة ملك البحرين. وهو عضو في العائلة المالكة آل خليفة التي تحكم البحرين منذ القرن الثامن عشر.
درس الشيخ ناصر بن حمد آل خليفة في الأكاديمية الملكية العسكرية ساندهيرست في المملكة المتحدة. خدم في الجيش البحريني لعدة سنوات قبل تعيينه في المجلس الأعلى للشباب والرياضة في البحرين.
في عام 2013، تم تعيينه وزيرًا للدولة لشؤون الدفاع. الشيخ ناصر بن حمد آل خليفة شخصية شعبية في البحرين ويعتبر مرشحًا محتملاً لخلافة والده ملك حمد بن عيسى آل خليفة.